3月24—25日的欧盟柏林特别首脑会决不是成员国政府首脑之间“一次轻松的炉边谈话”，而是一次名副其实的“亲兄弟，明算账”式的讨价还价。
柏林会议是在欧盟机制发生严重危机的背景下召开的。权力日益膨胀的欧洲议会一再向首脑会施加压力，要求尽快确定新的委员会主席人选，取代3月15日已经宣布辞职的桑特。在德国总理施罗德的主持下，24日会议一开始仅用半个小时就一致决定由意大利前总理普罗迪尼作为桑特的接班人。速度之快，出人意料。
由于24日北约决定向南联盟动武，会议不得不中断正常议程，讨论科索沃局势，并先后两次发表声明，要求米洛舍维奇妥协。英法德三国的政府首脑还不得不抽空发表电视讲话，向各自的选民说明动武的理由。
对这次会议的主题，即对《2000年日程》的谈判，实际上是从24日夜才开始的。由于意、法、德三国政府首脑必须在26日向议会解释向南开战的理由，会议必须在此之前结束。但由于涉及到各国切身利益，“谈判进行得非常困难”。26日天将放亮时，各国终于达成了妥协，从而避免了可能比委员会辞职更为严重的内部危机。
柏林会议总共要算的是三笔账，也就是《2000年日程》所要解决的预算政策、农业政策和结构基金政策三大改革。
第一笔账是从2000年到2006年的7年中欧盟的预算应该是多少。出于对扩大后欧盟预算可能失控的担心，法国、德国、英国、荷兰、瑞典、奥地利等8个国家坚决主张把欧盟的预算限制在目前水平，即每年850多亿欧元。紧缩预算，控制公共开支是马约生效以来的基本趋势，西班牙、葡萄牙、希腊、爱尔兰等国虽然希望适当增加预算，但最终还是接受了“掏钱大户”的意见。
第二笔账是这些钱从哪里来，也就是各国之间如何分摊。欧盟目前主要财政来源包括三大块：根据共同贸易政策、农业政策提取的关税收入；各国上缴的部分增值税；按各国国内生产总值的分摊额。在这一机制下，德国每年的“纯贡献”（上缴的钱减去收回的钱）高达110亿欧元。科尔下台前已提出要减少德国的分摊额。施罗德上台后说得更坚决：“我们不能也不愿用德国支票来解决欧洲问题。”委员会和各成员国提了许多方案，但最终都没有被接受。最后决定在作微调后保留原有的基本结构，在2006年1月前再研究建立欧盟财政的自有来源。这就是说德国要继续充当“冤大头”。
第三笔账是这些钱怎么花。目前，农业和结构基金分别占总预算的49％和36％，包括行政、科研、对外援助在内的其他开支占15％。农业部长理事会经过几轮马拉松谈判，在柏林会议前已经就农业政策改革达成原则协议，但农业补贴的最大受益国法国仍有保留。柏林会议向法国作了让步，决定今后7年的农业总开支为3100亿欧元，再加上140亿欧元的农村发展费用。法国对此表示满意。
结构基金和团结基金，是为了体现成员国之间的团结用来帮助相对落后地区的发展基金。会议最后决定把今后7年结构基金总额定为2130亿欧元。PIB（人均国民生产总值）低于欧盟平均数90％的可享受团结基金，PIB低于75％的可享受结构基金。
另一项支出是从1984年后每年大约25亿欧元的英国回扣款。多数国家认为，随着英国经济整体水平的提高和农业开支的减少，对英国的回扣要重新考虑。英国却毫不退让；法国为了取得英国对农业政策的支持，也不同意取消回扣。会议最后只好作出今后给英国的回扣“每年逐步减少，到2006年减少2．2亿欧元”这样一个象征性决定。
在整个谈判过程中，法国在农业问题上，英国在回扣问题上，西班牙在结构基金问题上，态度都很强硬。作出最大让步的还是德国。施罗德说：“我们没有中奖，我们也知道没有希望中奖。”法国欧洲事务部长则称赞德国作为主席国“干得很漂亮”，“是把欧洲利益置于国家利益之上”。他承认，“如果德国不是主席国，它有可能达到目标”。希拉克也对会议结果表示满意，声称“法德发动机没有发生故障，否则就不可能达成今天的协议”。
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